Гинтоки применяет таинственную силу и попадает в будущее, где его не будет. Этот будущий мир очень странный и хаотичный. Гинтоки в этом хаосе встречает разных существ, а также Синпати и Кагуру и попадает в непредвиденную цепочку событий, где ему открывается ошеломляющая правда.
Макото Юки перевелся в частную академию Гэккокан и на него напал странный монстр, называемый Тенью. Он пробудил в юноше необычную силу, позволяющую вызывать Персону. Увидев большой потенциал Макото, члены секретного школьного клуба SEES, ведущие борьбу с этими существами, предлагают парню присоединиться к ним. Всегда от всего отстраненный Макото равнодушно принимает предложение, однако со временем он начинает чувствовать крепкую связь с новыми товарищами.
Противостояние главного героя и команды SEES со странными монстрами, называемыми Тенями, приближается к концу. Макото и его сторонники ведут сражения насмерть, чтобы положить конец Тёмному Часу. В окружении Макото появляется загадочный студент по обмену. Шестерни судьбы начинают вращаться с каждым новым утром для SEES. Между героями нарастает напряжение.
Макото и его союзники выросли и прошли через много встреч, расставаний и испытаний. Их борьба ведется уже не ради мира, а ради их самих. Они продолжают сражаться, веря, что в конце их ждут мирные дни. Однако Юки утверждает, что разрушение — это судьба человечества, которую люди должны принять.
27-летняя Мирэ, офисная сотрудница из Токио, только что вернулась в Японию. 22-летняя студентка Сора стремится стать учителем, а 20-летняя фрилансер Рэйка подрабатывает в кафе окономияки в Хиросиме. Наполненная магией история начинается, когда загадочный случай сводит их вместе и вынуждает отправиться навстречу приключениям.